دانش آموختگان مقاطع کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری حرفه ای برای تکمیل آموخته های قبلی خود می توانند به ترتیب در مقاطع بالاتر نظیر کارشناسی ارشد، دکتری تخصصی (Ph.D.)، تخصص و فوق تخصص به ادامه تحصیل بپردازند.

هدف کلی مدیریت تحصیلات تکمیلی دانشگاه حفظ و توسعه کمی و کیفی تحصیلات تکمیلی در دانشگاه و نظارت بر اجرای قوانین مربوطه می باشد.

در حال حاضر دانشگاه علوم پزشکی شیراز در  ۵۳ رشته کارشناسی ارشد، 49 رشته دکتری تخصصی، ۲۰ رشته دکتری پژوهشی، ۲۲ رشته فوق تخصص، ۳۲ رشته تخصص و 36 رشته فلوشیپ دانشجو می پذیرد. 

عناوین مهم ترین فعالیت های مدیریت تحصیلات تکمیلی دانشگاه به شرح زیر است:

۱. توسعه کمی و کیفی تحصیلات تکمیلی دانشگاه
۲.  نظارت بر اجرای مقررات و آیین نامه های آموزشی تحصیلات تکمیلی
۳.  نظارت بر کیفیت دوره های آموزشی و پژوهشی دانشجویان تحصیلات تکمیلی
۴.  ایجاد هماهنگی و نظارت در امور آموزشی و پژوهشی دانشجویان دوره های تکمیلی

5.پیگیری تاسیس رشته های جدید در مقاطع مختلف تحصیلات تکمیلی براساس سند توسعه متوازن و برگزاری جلسات شورای مشورتی کلان منطقه5

6. تشکیل شورای تحصیلات تکمیلی جهت رسیدگی به مسایل مربوط به امور آموزش و پژوهشی و ایجاد هماهنگی به منظور وحدت رویه در اجرای آیین نامه ها در دانشکده ها
7.  انجام امور مربوط به دانشجویان بورس  
8.  اعلام و تنظیم ظرفیت پذیرش دانشجویان کارشناسی ارشد و  Ph.D.
9.  بررسی شرایط دانشجویان Ph.D. داوطلب شرکت در آزمون جامع و نظارت بر حسن اجرای برگزاری آزمون جامع(کتبی و شفاهی) در دانشکده ها و تعیین نماینده معاونت آموزشی و معاونت پژوهشی برای برگزاری این آزمون
10.  بررسی و تایید طرح های تحقیقاتی مربوط به پایان نامه دانشجویان کارشناسی ارشد و  Ph.D.

11. انجام امور نهایی فارغ التحصیلی دانشجویان تحصیلات تکمیلی و کنترل پایان نامه ها